Information on the East Asian - Tai-Kadai Metapopulation

The Tai-Kadai Metapopulation (East Asian - Tai-Kadai) consists of 7741 haplotypes (at least minimal) and 19 unique population samples.

Most common haplotypes

Count	DYS19	DYS389I	DYS389II	DYS390	DYS391	DYS392	DYS393	DYS385
168	15	12	29	24	10	13	15	14,16
132	14	12	28	24	10	14	12	13,17
90	15	12	28	24	10	13	15	14,16
87	14	12	30	24	10	11	13	15,15
72	15	14	31	24	10	13	14	14,18
71	14	12	28	25	10	14	12	13,17
71	15	13	31	23	10	11	15	11,11
60	17	12	28	24	10	13	12	13,22
53	14	12	30	24	10	11	13	15,16
49	15	12	28	23	10	14	13	13,13

Count	DYS391	DYS389I	DYS439	DYS389II	DYS438	DYS437	DYS19	DYS392	DYS393	DYS390	DYS385
148	10	12	11	29	10	14	15	13	15	24	14,16
84	10	12	12	28	11	15	14	14	12	24	13,17
80	10	12	11	28	10	14	15	13	15	24	14,16
74	10	12	11	30	11	15	14	11	13	24	15,15
69	10	13	11	31	10	14	15	11	15	23	11,11
69	10	14	11	31	11	14	15	13	14	24	14,18
46	10	12	11	30	11	15	14	11	13	24	15,16
35	10	13	11	29	10	14	17	13	12	25	12,19
35	11	13	12	28	9	14	15	14	15	24	15,21
31	10	12	11	28	10	14	15	11	12	21	11,17

Count	DYS456	DYS389I	DYS390	DYS389II	DYS458	DYS19	DYS385	DYS393	DYS391	DYS439	DYS635	DYS392	YGATAH4	DYS437	DYS438	DYS448
56	14	12	24	29	18	15	14,16	15	10	11	23	13	10	14	10	18
56	14	12	24	30	16	14	15,15	13	10	11	19	11	12	15	11	19
44	15	13	23	31	15	15	11,11	15	10	11	22	11	11	14	10	21
43	15	14	24	31	16	15	14,18	14	10	11	20	13	10	14	11	18
33	15	13	24	28	15	15	15,21	15	11	12	21	14	11	14	9	18
31	14	12	24	30	16	14	15,16	13	10	11	19	11	12	15	11	19
29	15	12	24	28	18	15	14,16	15	10	11	23	13	10	14	10	18
23	15	12	24	28	19	14	13,17	12	10	12	20	14	12	15	11	20
23	15	12	24	29	18	15	14,16	15	10	11	23	13	10	14	10	18
22	15	12	24	28	20	14	13,17	12	10	12	20	14	12	15	11	20

Count	DYS576	DYS389I	DYS448	DYS389II	DYS19	DYS391	DYS481	DYS549	DYS533	DYS438	DYS437	DYS570	DYS635	DYS390	DYS439	DYS392	DYS643	DYS393	DYS458	DYS385	DYS456	YGATAH4
19	17	13	21	31	15	10	27	12	12	10	14	15	22	23	11	11	8	15	15	11,11	15	11
5	20	12	19	28	16	10	27	13	11	10	14	17	20	25	12	13	10	12	17	12,19	15	12
4	16	13	18	28	14	10	24	13	11	10	14	20	19	23	12	14	11	13	15	13,14	15	12
4	16	13	18	29	14	10	24	14	11	10	14	18	19	23	12	14	11	13	16	13,14	16	12
4	17	13	21	31	15	10	27	12	12	10	14	15	21	23	11	11	8	15	15	11,11	15	11
4	18	12	20	28	16	10	26	12	11	10	14	19	25	21	11	11	9	12	17	11,17	15	11
4	18	13	21	31	15	10	27	12	12	10	14	15	22	23	11	11	8	15	15	11,11	15	11
4	19	13	18	30	16	11	23	13	10	10	14	17	23	24	12	13	12	14	16	13,18	15	11
4	20	12	20	28	14	10	24	12	11	11	15	16	20	24	12	14	12	12	19	13,17	15	12
4	20	12	20	28	14	10	24	12	11	11	15	16	20	24	12	14	12	12	20	13,17	15	12

Count	DYS576	DYS389I	DYS635	DYS389II	DYS627	DYS460	DYS458	DYS19	YGATAH4	DYS448	DYS391	DYS456	DYS390	DYS438	DYS392	DYS518	DYS570	DYS437	DYS385	DYS449	DYS393	DYS439	DYS481	DYF387S1	DYS533
28	19	12	23	29	21	11	18	15	10	18	10	14	24	10	13	39	16	14	14,16	27	15	11	23	36,39	10
16	18	12	19	30	19	11	16	14	12	19	10	14	24	11	11	37	19	15	15,15	26	13	11	26	36,36	12
12	17	12	19	30	21	11	15	15	12	18	11	17	24	10	14	38	17	14	13,13	32	13	11	25	38,39	11
11	18	14	25	30	21	10	17	15	11	18	11	15	25	10	13	41	16	14	16,17	30	14	12	23	37,38	10
9	18	12	19	30	19	11	16	14	12	19	10	14	24	11	11	37	19	15	15,15	26	13	11	26	36,39	12
9	18	12	21	28	19	9	16	16	12	20	11	15	23	10	13	39	20	15	16,16	32	12	11	24	37,41	12
8	18	12	24	28	21	10	18	15	10	18	10	15	24	10	13	39	16	14	14,16	27	15	11	23	36,39	10
8	18	12	25	29	21	10	18	15	10	18	10	14	24	10	13	39	16	14	14,16	26	15	11	23	35,39	10
8	20	12	20	28	18	9	18	14	12	20	10	15	25	11	14	35	18	15	13,17	33	12	15	23	35,39	11
8	20	12	21	28	20	10	17	16	12	19	10	14	25	10	13	39	17	14	12,19	31	12	12	26	35,37	11

Count	DYS19	DYS389I	DYS389II	DYS390	DYS391	DYS392	DYS393	DYS385	DYS438	DYS439	DYS437	DYS448	DYS456	DYS458	DYS635	YGATAH4	DYS481	DYS533	DYS549	DYS570	DYS576	DYS643	DYF387S1	DYS449	DYS460	DYS518	DYS627
5	16	12	28	25	10	13	12	12,19	10	12	14	19	15	17	20	12	27	11	13	17	20	10	35,37	32	10	38	20
3	15	13	31	23	10	11	15	11,11	10	11	14	21	15	15	22	11	27	12	12	15	17	8	36,37	30	11	41	22
2	13	13	30	22	10	14	14	11,12	10	10	14	19	16	15.1	22	11	22	11	13	21	16	11	36,36	30	10	36	23
2	14	12	28	23	11	14	12	13,18	11	11	14	20	15	18	20	12	24	11	13	19	19	11	35,38	35	9	36	19
2	14	12	28	24	10	14	12	13,17	11	12	15	20	15	19	20	12	24	11	12	16	20	12	35,37	33	9	35	18
2	14	12	30	24	10	11	13	15,15	11	11	15	19	14	16	19	11	25	11	12	18	18	10	38,39	25	11	37	19
2	14	13	28	23	10	14	13	13,15	10	13	14	18	16	15	19	12	24	11	13	20	16	11	36,41	30	11	35	22
2	14	13	29	23	10	14	13	13,13	10	12	14	18	15	16	20	12	24	11	12	20	16	11	36,39	30	11	38	21
2	14	13	29	23	11	14	13	11,12	11	11	14	19	15	17	21	13	22	12	13	19	19	10	36,36	26	11	39	21
2	14	13	30	24	10	11	13	17,20	9	10	15	20	15	16	20	11	24	11	12	16	19	10	37,40	27	10	39	20

Population samples

Population Sample	Minimal	PowerPlex Y	Yfiler	PowerPlex Y23	Yfiler Plus	Maximal
Chiang Mai, Thailand [Thai]	103 Haplotypes	32 Haplotypes	32 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes
Central Thailand, Thailand [Thai]	757 Haplotypes	757 Haplotypes	256 Haplotypes	256 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes
Guangxi, China [Zhuang]	2913 Haplotypes	2913 Haplotypes	2913 Haplotypes	266 Haplotypes	2314 Haplotypes	0 Haplotypes
Xishuangbanna, China [Dai]	92 Haplotypes	92 Haplotypes	92 Haplotypes	92 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes
Laos [Laotian]	45 Haplotypes	45 Haplotypes	45 Haplotypes	0 Haplotypes	45 Haplotypes	0 Haplotypes
Hunan, China [Dong]	723 Haplotypes	723 Haplotypes	723 Haplotypes	643 Haplotypes	643 Haplotypes	643 Haplotypes
Northern Thailand, Thailand [Yong]	124 Haplotypes	124 Haplotypes	124 Haplotypes	124 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes
Northern Thailand, Thailand [Northern Thai]	15 Haplotypes	15 Haplotypes	15 Haplotypes	15 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes
Northern Thailand, Thailand [Shan]	12 Haplotypes	12 Haplotypes	12 Haplotypes	12 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes
Guangxi, China [Maonan]	135 Haplotypes	135 Haplotypes	135 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes
Guizhou, China [Shui]	200 Haplotypes	200 Haplotypes	200 Haplotypes	200 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes
Guizhou, China [Gelao]	531 Haplotypes	531 Haplotypes	531 Haplotypes	234 Haplotypes	297 Haplotypes	0 Haplotypes
Qiannan_Guizhou, China [Bouyei]	98 Haplotypes	98 Haplotypes	98 Haplotypes	98 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes
Thailand [Thai]	140 Haplotypes	140 Haplotypes	140 Haplotypes	0 Haplotypes	140 Haplotypes	0 Haplotypes
Guangxi, China [Gelao]	156 Haplotypes	156 Haplotypes	156 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes
Hainan, China [Li]	524 Haplotypes	524 Haplotypes	524 Haplotypes	0 Haplotypes	524 Haplotypes	0 Haplotypes
Hainan, China [Lingao]	487 Haplotypes	487 Haplotypes	487 Haplotypes	0 Haplotypes	487 Haplotypes	0 Haplotypes
Guizhou, China [Bouyei]	400 Haplotypes	400 Haplotypes	400 Haplotypes	400 Haplotypes	400 Haplotypes	400 Haplotypes
Zunyi_Guizhou, China [Gelao]	286 Haplotypes	286 Haplotypes	286 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes	0 Haplotypes
(Overall)	7741 Haplotypes	7670 Haplotypes	7169 Haplotypes	2340 Haplotypes	4850 Haplotypes	1043 Haplotypes

Discrete-Laplace frequency estimation (Minimal)

Release: R61
Loci included: DYS19, DYS389I, DYS389II^*, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393
Central haplotypes: 41
EM converged: true
EM iterations: 50
GLM method: internal_coef
Init method: pam
Per locus details: DL centers distribution (download PDF)

Table of haplotype centers (click to show/hide)

	DYS19	DYS389I	DYS389II^*	DYS390	DYS391	DYS392	DYS393
1	14	12	16	25	10	14	12
2	15	13	17	25	11	11	13
3	15	12	18	23	10	14	13
4	14	12	16	23	10	14	12
5	14	12	16	24	10	14	12
6	14	12	18	24	10	11	13
7	15	13	17	25	11	13	13
8	15	12	16	21	10	11	12
9	15	13	18	23	10	11	15
10	16	12	16	25	10	13	12
11	16	13	16	22	10	13	12
12	15	12	16	23	10	12	12
13	15	13	16	25	10	13	14
14	15	12	17	23	10	14	13
15	15	12	18	23	10	13	12
16	15	12	17	24	10	13	15
17	15	14	16	24	10	12	12
18	15	13	16	24	11	13	14
19	15	13	16	24	10	13	14
20	14	14	16	22	10	14	14
21	15	14	17	24	10	13	14
22	16	12	16	23	11	13	12
23	16	12	16	24	10	13	12
24	16	13	17	24	10	13	14
25	16	13	17	24	11	13	14
26	17	12	16	24	10	13	12
27	15	14	16	25	11	13	14
28	16	13	16	23	10	11	14
29	16	13	16	24	11	13	14
30	16	13	16	24	10	13	14
31	13	14	16	24	9	14	14
32	15	12	16	23	10	14	13
33	15	13	17	24	10	13	12
34	17	13	16	25	10	13	12
35	15	12	16	24	10	13	15
36	14	13	16	23	10	14	13
37	15	14	16	23	10	11	15
38	16	14	16	24	10	14	12
39	14	14	17	23	11	14	13
40	15	12	17	23	11	14	13
41	15	13	15	24	11	14	15

Discrete-Laplace frequency estimation (Yfiler)

Release: R61
Loci included: DYS19, DYS389I, DYS389II^*, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS437, DYS438, DYS439, DYS448, DYS456, DYS458, DYS635, YGATAH4
Central haplotypes: 40
EM converged: true
EM iterations: 38
GLM method: internal_coef
Init method: pam
Per locus details: DL centers distribution (download PDF)

Table of haplotype centers (click to show/hide)

	DYS19	DYS389I	DYS389II^*	DYS390	DYS391	DYS392	DYS393	DYS437	DYS438	DYS439	DYS448	DYS456	DYS458	DYS635	YGATAH4
1	16	13	16	24	11	13	14	14	10	11	18	15	19	22	11
2	15	13	16	24	11	13	14	14	10	12	18	15	16	21	11
3	17	13	17	24	11	13	14	14	10	11	17	15	17	22	11
4	15	12	16	23	10	14	13	14	10	11	18	15	15	20	12
5	15	13	16	25	10	13	14	14	10	12	18	15	16	22	11
6	17	12	16	24	10	13	12	15	10	11	20	15	19	23	12
7	14	12	18	24	10	11	13	15	11	11	19	14	16	19	12
8	16	13	17	24	11	13	14	14	10	12	18	15	17	22	11
9	15	12	16	23	10	12	12	15	10	12	19	15	18	20	12
10	15	13	18	23	10	11	15	14	10	11	21	15	15	22	11
11	15	13	16	24	10	13	14	14	10	11	18	15	17	23	10
12	13	14	16	24	9	14	14	14	12	11	19	16	17	22	10
13	16	12	16	23	10	14	13	14	10	11	16	16	18	21	12
14	15	14	17	25	11	11	13	14	10	12	21	15	16	22	12
15	16	12	16	23	10	13	12	15	10	11	20	15	17	21	12
16	16	12	16	25	10	13	12	14	10	12	19	14	17	22	12
17	14	12	16	24	10	14	12	15	11	12	20	15	20	20	12
18	15	12	17	24	10	13	15	14	10	11	18	15	18	23	10
19	15	12	16	21	10	11	12	14	10	11	20	15	18	24	11
20	14	12	16	23	10	14	12	14	11	11	20	15	17	20	12
21	15	12	18	23	10	13	12	14	10	11	19	15	18	21	11
22	14	12	16	24	10	14	12	15	11	12	20	15	18	20	12
23	15	12	16	24	10	13	15	14	10	11	18	15	18	23	10
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40	17	13	16	25	10	13	12	14	10	11	18	15	20	22	12

^* Please note that DYS389I was substracted from DYS389II

	DYS19	DYS389I	DYS389II^*	DYS390	DYS391	DYS392	DYS393
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Information on the East Asian - Tai-Kadai Metapopulation

Metapopulation substrcuture

Most common haplotypes

Population samples

Discrete-Laplace frequency estimation (Minimal)

Discrete-Laplace frequency estimation (Yfiler)

	DYS19	DYS389I	DYS389II^*	DYS390	DYS391	DYS392	DYS393
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